签订三方协议后，毕业生通常仍然保留其应届生身份。这里有几个关键点需要明确：

1. 应届生身份的定义：应届生通常指的是在毕业年度内未就业的毕业生。这个身份主要与毕业生的毕业时间相关，而与是否签订三方协议没有直接关系。

2. 三方协议的作用：三方协议是毕业生、用人单位和学校之间的一份意向性协议，主要用于明确毕业生的就业意向和用人单位的招聘意向。它并不是正式的劳动合同，因此，签署三方协议并不会使毕业生失去应届生身份。

3. 社保和就业状态：应届生身份的丧失通常与毕业生是否开始正式工作并缴纳社会保险相关。如果毕业生在签订三方协议后并未正式入职，未缴纳社保，那么其应届生身份通常不受影响。

4. 特殊情况：有些用人单位可能在三方协议中包含特殊条款，如要求毕业生提前入职或视为已就业，这可能会影响应届生身份。此外，如果毕业生在签订三方协议后正式工作并缴纳社保，那么其应届生身份可能会受到影响。

5. 政策差异：不同地区和不同学校对应届生身份的具体认定可能存在差异，因此，具体情况还需根据当地政策和学校规定来判断。

总结来说，一般情况下，签订三方协议并不会影响毕业生的应届生身份，但这取决于协议的具体内容以及毕业生是否开始正式工作并缴纳社保。如果对应届生身份有疑问，建议咨询学校就业指导中心或相关法律专业人士。